Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM30AQ9NV96 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms