Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDH12Q9NPG4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH12Q9NPG4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms