Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD1Q9H3U5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD1Q9H3U5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms