Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD4Q9H223 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD4Q9H223 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms