Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG9Q9H0W8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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