Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM31Q9BZY9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM31Q9BZY9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms