Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms