Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms