Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF8Q9BRL6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms