Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN18Q99952 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms