Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POP1Q99575 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POP1Q99575 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POP1Q99575 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP1Q99575 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP1Q99575 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP1Q99575 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POP1Q99575 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP1Q99575 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP1Q99575 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP1Q99575 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP1Q99575 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POP1Q99575 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP1Q99575 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP1Q99575 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POP1Q99575 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POP1Q99575 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
POP1Q99575 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POP1Q99575 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POP1Q99575 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POP1Q99575 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POP1Q99575 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms