Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOTCH4Q99466 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTCH4Q99466 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms