Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP57Q96MR6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms