Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC17Q96LX7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms