Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COG3Q96JB2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG3Q96JB2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms