Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms