Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF12Q8WXF0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms