Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms