Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms