Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP38Q8NB14 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms