Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAAF3Q8N9W5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms