Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF1Q8N6C5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms