Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC105Q8IYK2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC105Q8IYK2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC105Q8IYK2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC105Q8IYK2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC105Q8IYK2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC105Q8IYK2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC105Q8IYK2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms