Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LCA5Q86VQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LCA5Q86VQ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms