Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG4DQ86TL0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms