Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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