Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIMS2Q7Z4I7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms