Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC6Q7Z403 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms