Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP9Q7RTR0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP9Q7RTR0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms