Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms