Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM1Q6UX27 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms