Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC171Q6TFL3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC171Q6TFL3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms