Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC137Q6PK04 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC137Q6PK04 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms