Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD3Q6PCD5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms