Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM4Q6P4Q7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms