Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEPROQ6NW34 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEPROQ6NW34 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms