Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms