Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM29Q5VYK3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms