Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms