Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR3Q5GH77 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms