Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP3Q53F19 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms