Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC1Q4VXA5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms