Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms