Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1644Q3SXP7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms