Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
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