Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHHQ15465 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHHQ15465 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHHQ15465 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHHQ15465 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHHQ15465 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHHQ15465 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHHQ15465 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHHQ15465 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHHQ15465 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHHQ15465 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHHQ15465 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHHQ15465 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHHQ15465 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHHQ15465 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHHQ15465 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHHQ15465 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHHQ15465 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHHQ15465 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHHQ15465 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHHQ15465 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHHQ15465 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHHQ15465 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHHQ15465 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHHQ15465 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHHQ15465 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHHQ15465 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHHQ15465 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHHQ15465 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHHQ15465 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHHQ15465 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHHQ15465 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHHQ15465 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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