Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC23BQ15437 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SEC23BQ15437 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SEC23BQ15437 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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SEC23BQ15437 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SEC23BQ15437 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SEC23BQ15437 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SEC23BQ15437 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SEC23BQ15437 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC23BQ15437 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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