Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IHHQ14623 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IHHQ14623 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IHHQ14623 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IHHQ14623 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IHHQ14623 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IHHQ14623 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IHHQ14623 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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