Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1CQ14123 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE1CQ14123 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms