Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGB1Q14028 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
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